Le secteur de l’agriculture reste largement vulnérable aux changements climatiques et la production agricole se voit négativement impactée par les effets de la sécheresse, la salinité, les maladies et les ravageurs. Le séquençage, la génomique, la transcriptomique et la métagénomique constituent des atouts pour pallier ses contraintes, et contribuent par conséquent à la conservation des germoplasmes et garantissent la souveraineté alimentaire.

Le Programme Biotechnologie pour le Développement de l’Agriculture Nationale a ainsi pour objectif de contribuer à une meilleure valorisation des ressources génétiques et améliorer les cultures (arganier, palmier dattier, céréales, arboriculture fruitière, etc.), notamment par l’adoption et l’utilisation des technologies biotechnologiques (génomique, transcriptomique, bioinformatique).

L’accélération de ces programmes de sélection à l’INRA a permis une meilleure caractérisation des cultures prioritaires et des agents pathogènes pour augmenter le nombre de variétés candidates pour inscription au catalogue officiel ainsi que l’obtention de variétés performantes résistantes aux stress biotiques et abiotiques. Ces technologies biotechnologiques utilisées permettent aussi une identification variétale par les outils moléculaires afin de soutenir le programme national de production de vitroplants de palmier dattier, ainsi que l’exploration des génomes de l'arganier et du palmier dattier pour générer des marqueurs moléculaires à exploiter pour accélérer les programmes de sélection et de conservation de ces 2 cultures stratégiques. Le Programme Biotechnologie pour le Développement de l’Agriculture Nationale avance selon les axes ci-dessous :

• Etablissement d’une base de référence de variétés de palmier dattier par l'utilisation de marqueurs moléculaires de type SSRs (Majhoul, Boufeggous, Bouzekri, Najda, Aziza, Boufeggous-Aghrass et de 2 mâles) ;
• Analyse de plus de 11 000 échantillons de vitro-plants issus des différents laboratoires privés de culture in vitro pour s'assurer de l'identité variétale des vitroplants produits ;
• Transfert et diffusion de l’expertise INRA aux partenaires de l’institut : ONSSA (Office National de Sécurité Sanitaire des Produits Alimentaires) et laboratoires privés d'analyse ;
• Séquençage partiel des variétés du palmier dattier (Majhoul, Boufeggous, Bouzekri, Nejda et 2 mâles) et identification des SNPs spécifiques ;
• Assemblage du premier draft génome nucléaire de l’arganier (671Mb) ;
• Assemblage complet du génome chloroplastique de l'arganier (158kb) ;
• Caractérisation, à l’échelle du Maroc, par des outils moléculaires (SSRs, SRAP, l’AFLP, et la RAPD), de la diversité génétique, de la virulence et la cartographie des groupes génétiques des principaux agents pathogènes causant la septoriose, la fusariose du blé et la rayure réticulée chez l’orge et l'orobanche chez les légumineuses ;
• Assistance des programmes de sélection pour le développement de nouvelles variétés de qualité et résistantes aux stress biotique et abiotiques ;
• Application et validation des marqueurs moléculaires de types SSRs, AFLP, RAPD.